Desde 2018, médicos especialistas cubanos han trabajado en hospitales de la capital Ulán Bator, aportando experiencia en cardiología, oncología y reumatología. 

La colaboración incluye también la formación de profesionales mongoles, más de cien de los cuales han estudiado medicina en universidades cubanas, regresando para fortalecer el sistema de salud local.

En 2021, los ministerios de salud de ambos países firmaron un Memorando de Entendimiento para consolidar la cooperación en atención médica, investigación, prevención de enfermedades y biotecnología. La colaboración cubana se centra en intercambio profesional, capacitación y proyectos técnicos especializados, contribuyendo significativamente al desarrollo del sistema de salud mongol y reflejando la política internacionalista de Cuba en salud.